N端测序分析在蛋白质组学中主要用于解析蛋白质或多肽的N端氨基酸序列，为研究蛋白质的翻译后修饰、降解过程及结构信息提供关键数据。传统的Edman降解法由于对样本量和蛋白性质的限制，在处理复杂样本或N端封闭蛋白时存在一定局限。相比之下，基于质谱的N端测序方法凭借其高灵敏度、高通量的优势，能够在低浓度样本中实现精准检测，并解析复杂蛋白质混合物的N端序列。

在生物制药研究中，N端测序技术广泛应用于蛋白药物质量控制、工艺优化、稳定性研究等方面。通过质谱分析，研究者可以确保蛋白药物的N端序列完整性、识别翻译后修饰、监测蛋白降解情况，并优化生产工艺，从而提升生物药物的质量与稳定性。

一、生物制药研究中的N端测序分析应用

1、蛋白质药物的完整性验证

在重组蛋白和单克隆抗体的生产过程中，确保N端序列的正确性至关重要。基于质谱的N端测序可用于确认N端残基是否符合设计序列，同时检测可能的蛋白酶切割或加工错误，从而保障药物质量的一致性。

2、翻译后修饰（PTMs）分析

生物药物的N端常经历乙酰化、甲酰化或环化等翻译后修饰，这些修饰可能影响药物活性、稳定性及免疫原性。质谱N端测序能够精准识别这些修饰，并提供定量信息，为优化生产工艺和提高产品一致性提供依据。

3、降解与稳定性研究

蛋白药物在储存和运输过程中可能因氧化、脱酰胺、蛋白酶降解等因素发生结构变化，从而影响其稳定性。N端测序可用于监测蛋白降解模式，揭示降解机制，并优化储存条件，以提升药物稳定性和货架期。

4、工艺开发与优化

质谱N端测序可用于评估不同表达系统（如CHO细胞、酵母、大肠杆菌）或不同纯化工艺（如亲和纯化、离子交换、凝胶过滤）对蛋白N端结构的影响，助力优化生产工艺，提高产品质量。

二、基于质谱的N端测序技术优势

1、高灵敏度与高通量

传统Edman降解法对样品量要求较高，且难以解析N端封闭蛋白，而基于质谱的方法可在低浓度样本中实现高灵敏度检测，并可并行分析多个样本，提高检测效率。

2、适用于复杂蛋白质混合物

生物药物通常包含多个蛋白亚型或杂质，质谱N端测序能够直接解析复杂混合物中的目标蛋白N端序列，无需单独纯化目标蛋白，从而提高分析效率。

3、灵活的蛋白酶消化策略

基于质谱的N端测序可采用非特异性蛋白酶（如LysC、AspN、GluC等）或限制酶解策略，生成适合质谱检测的N端肽段，避免传统方法对特定酶解位点的依赖，提高方法的普适性。

4、解析翻译后修饰

质谱N端测序不仅能确定氨基酸序列，还能解析N端翻译后修饰（如乙酰化、甲酰化、环化等），这些信息对蛋白药物的稳定性和生物学活性评估至关重要。

三、基于质谱的N端测序分析流程

1、样本制备与蛋白酶解

选择合适的蛋白酶（如LysC、AspN等）进行消化，以生成适合质谱分析的N端肽段，并结合化学修饰或亲和富集方法，提高N端肽的检测效率。

2、液相色谱-质谱分析（LC-MS/MS）

采用高分辨率质谱仪（如Orbitrap、Q-TOF），结合CID、HCD或ETD等碎裂模式，精准检测肽段并解析N端序列信息。

3、数据分析与序列匹配

利用数据库搜索（如Mascot、MaxQuant）或开放搜索策略，鉴定N端序列，同时识别可能的翻译后修饰。

4、结果验证与定量分析

采用内标定量或相对定量方法，评估N端修饰比例及蛋白变异情况，确保数据的准确性和可靠性。

基于质谱的N端测序分析在生物制药研究中，能够为蛋白质药物的质量控制、稳定性研究、工艺优化等提供关键数据支持。凭借高灵敏度、高通量及广泛适用性，该技术已成为蛋白质结构表征的重要工具。百泰派克生物科技提供优质的基于质谱的N端测序分析服务，欢迎联系我们！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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